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技術(shù)文章 / article
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慢病毒整合位點標準品強勢來襲

原載自:www.ab143.cn[技術(shù)資料頻道]  2024-11-11  瀏覽次數(shù):62

 

嵌合抗原受體T細胞(Chimeric antigen receptor Tcell, CAR-T)免疫療法是將應用基因修飾技術(shù)制備表達,嵌合抗原受體(Chimeric antigen receptor, CAR)的T淋巴細胞,經(jīng)體外擴增后再回輸至患者體內(nèi)的一種個體化治療方法。
 
近年來,隨著Kymriah,  Yescarta 以及 Strimvelis等細胞治療產(chǎn)品陸續(xù)推上市場,慢病毒作為細胞裝載CAR過程的關(guān)鍵中間載體,確保慢病毒為基礎(chǔ)的藥物質(zhì)量和安全性挑戰(zhàn)巨大。去年年底FDA公布調(diào)查CAR-T療法的安全性問題—T細胞癌癥風險的出現(xiàn)被認為源于其使用的基因遞送載體-慢病毒載體后,于今年1月31日正式發(fā)布“ Considerations for the development of Chimeric Antigen Receptor (CAR) T Cell Products"指導原則。當中建議根據(jù)風險評估來確定載體拷貝數(shù)(VCN)的放行標準。風險評估包括插入位點分析、克隆優(yōu)勢、劑量、適應癥、研究人群等研究支持的實驗數(shù)據(jù)。國家藥品監(jiān)督管理局藥品審批中心(CDE)發(fā)布的《基因修飾細胞治療產(chǎn)品非臨床研究與技術(shù)指導原則》也將“插入突變風險評估"作為非臨床安全性研究的內(nèi)容,并詳細規(guī)定關(guān)鍵風險因素的評估要點,因此CAR-T治療需要評估潛在的插入突變風險和致癌性風險。
 

 

慢病毒整合位點檢測方法

 

 
 
目前檢測慢病毒整合位點的主要平臺為高深度測序(NGS)。
 
表格整理_Sheet1.png
Table 1. 常見慢病毒整合位點檢測方法比較
 
綜合考慮,科佰選擇多種方法(捕獲探針法測序+ sanger + ddPCR)驗證,充分驗證標準品的準確性。在驗證過程中,捕獲探針法測序技術(shù)針對慢病毒整合位點檢測的準確性得到了很好的驗證。
 
 

慢病毒整合位點標準品

我國在2021年連續(xù)出臺了4部基因治療相關(guān)產(chǎn)品的指導原則都指出慢病毒整合檢測至少要包含1. 整合方向 2. 整合位置 3. 特定整合位置和整合方向的絕對克隆數(shù)目。
 
針對這一要求,科佰現(xiàn)推出慢病毒整合位點標準品

 

表格整理_Sheet2(3).png

 
部分產(chǎn)品數(shù)據(jù)展示:
 

圖片1.png

Fig 1. Results of CBPL0002 by NGS (Probe capture method).
 
通過NGS(捕獲探針法測序)技術(shù),結(jié)合生信分析方法,選取1000×以上Reads數(shù)的基因進行Sanger以及ddPCR法驗證,同時采用ddPCR方法檢測整合頻率。多種方法相結(jié)合,準確定位慢病毒插入位點以及整合頻率。
 

圖片2.png

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Fig 2.Results of CBPL0002 by Sanger sequencing.
 

DdPCR.png

 

Fig 3.Results of CBPL0002 by ddPCR.

 
根據(jù)NGS(捕獲探針法測序)結(jié)果確定慢病毒插入位點,通過Sanger測序以及ddPCR法再次驗證,準確定位慢病毒插入位點以及整合頻率。
 
CAR-T細胞療法被認為是最有前途的癌癥治療方法之一,其在血液系統(tǒng)瘤中的運用已取得了優(yōu)異的療效,可靠的檢測方法可以準確有效分析慢病毒插入位點,協(xié)助客戶評估插入突變的可能性以及相關(guān)的風險,提高細胞免疫治療的安全性。
 

慢病毒整合位點檢測服務(wù)

 
科佰現(xiàn)推出針對慢病毒整合位點檢測服務(wù)(捕獲探針法測序技術(shù))。捕獲探針法測序技術(shù)主要是針對LTR區(qū)域做探針捕獲,PCR后,NGS測序驗證,結(jié)合生信分析方法,判斷慢病毒插入位點。后續(xù)同時采用了sanger以及ddPCR方法對NGS(捕獲探針法測序)技術(shù)進行了驗證,NGS(捕獲探針法測序)檢測出的位點,sanger以及ddPCR方法均檢出。

表格整理_Sheet3.png

慢病毒插入位點檢測服務(wù)(捕獲探針法測序)可以協(xié)助您準確定位慢病毒插入位點,慢病毒整合位點標準品不僅可以適用于多種檢測方法,協(xié)助您判斷方法的準確性,還可以用于定位檢測方法的檢測限。

 

科佰生物

科佰生物推出慢病毒整合位點標準品以及慢病毒插入位點檢測服務(wù)(捕獲探針法測序)?!爱a(chǎn)品+技術(shù)服務(wù)",總有一款適合你!

 

 

 

 

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